根本にはこの時、敵の総帥である蒋介石に対して、言葉では言い表せない感謝の気持ちがあった。それは、日本の国体、すなわち天皇制の存続に関する問題である。

二年前の一九四三年十一月にエジプトのカイロでおこなわれた「カイロ会談」は、アメリカのルーズベルト大統領とイギリスのチャーチル首相と中華民国主席の蒋介石の三者によるものである。

ここで連合国側の「日本の無条件降伏を目指す」という大方針や「北海道、本州、四国、九州の四島のみを日本の領土とする」ことなど、連合国の対日基本方針が定められている。

この会談のなかで、蒋介石は天皇制度について意見を述べ、それが「天皇制の存続につながった」ことを根本は知る。カイロ会談に随行した蒋介石の部下の海軍武官から根本は直接、会談の内情を聞かされたのである。
事実、蒋介石は、一九四三年十一月二十三日午後七時半からの晩餐会の席上、ルーズベルトから日本の将来の国体問題について意見を求められ、「日本の軍閥がまた立ち上がり、日本の政治に二度と関与することのないよう徹底的に取り除かねばならないが、日本の国体をどうするかについては、日本の新進のしっかりとした考えを持つ人々に自ら解決させるのが望ましい。我々は日本国民が自由な意志で自分たちの政府の形を選ぶのを尊重すべきである」と述べ、戦後になってから「日本国民が自ら決める」ことを主張し、ルーズベルトの賛同を得たという（「中華民國三十三年元旦告全國軍民同胞書」より）。
これは根本にとって大きな意味を持つことだった。無条件降伏でありながら天皇制、すなわち「国体」を存続できたことは、大元帥のもとでひたすら軍務に励んだ軍人としてはかり知れない喜びだったのである。そして、前月から在留邦人の故国日本への帰国も始まっていた。部下将兵たちが命に代えて守り抜いた人たちが続々、日本への帰還を果たしていくことに対しても、根本は深い喜びを感じていた。

根本は、敗軍の将としてこの時、死を覚悟して蒋介石の宿舎を訪ねている。だが、それ以上に感謝の思いが強かったのである。
根本は、椅子が二脚しかない書斎で蒋介石と対面した。

根本が部屋に入っていくと、蒋介石は、武官長官の商震上将、戦区司令長官の孫連仲上将など高官を立たせたまま、根本の手を取り、椅子に座らせた。

恐縮する根本に蒋介石は、にっこりと微笑みかけた。
「今でも私は東亜の平和は日本と手を握って行く以外にはないと思うんだよ」蒋介石は、そう口を開いた。
「今まで日本は少々、思いあがっていたのではないだろうか。しかし、今度はこれで私たちと日本は対等に手を組めるだろう。あなたは至急、帰国して、日本再建のために努力をして欲しい」
ねぎらいの言葉と共に、蒋は、諭すように根本に語りかけた。その態度には、戦勝国代表の騎りは微塵も感じられなかった、と根本はのちに回想している。

根本は感謝の言葉を蒋介石に述べた後、こう答えた。
「しかし閣下、私は三十五万の兵を残して先に帰国することはできません。北支那方面軍の司令官として、私は戦争の責任を問われなければなりません」
自ら北支那方面軍のトップとしての戦争責任を取ろうとする根本に、蒋介石は首をゆっくりと横に振った。
「戦争犯罪人の処罰は連合国の申し合わせだから仕方がない。しかし、いたずらに多数の戦犯を摘発し、日本の恨みは買いたくない」

そう言うと、蒋介石はさらにこう続けた。
「戦争である以上、罪は双方ともが犯している。だが、連合国からの強い要請もあるので、戦争以外のことで最も悪質なことをやった者だけにしぼって、戦犯として処理したい。中国側の責任者についても、その点、十分の注意を与えているつもりだが、もし日本側に不満があれば、遠慮なく申し出てください」

蒋介石の"日本の恨みは買いたくない。という言葉は、ある意味、リアルな表現である。この時、世界中が固唾を呑んで中国での「国共内戦」の行方を見守っていた。